Chemikalien, die in der DNA-Analyse verwendet werden

Die Analyse von DNA beinhaltet die Verwendung von Hunderten von verschiedenen Arten von Chemikalien.

Die Analyse von DNA beinhaltet verschiedene Arten von molekularen Experimenten und biologischen Verfahren. DNA ist ein fragiles und kompliziertes Rohmaterial. Um es zu handhaben und zu analysieren, bedarf es der besten QualitĂ€t und der reinsten Zubereitung von Chemikalien. AbhĂ€ngig von der Analyse sind Hunderte von Chemikalien, von sauren und basischen Lösungen bis hin zu Puffern und Farbstoffen, an der Untersuchung von DNA beteiligt. Zu verstehen, warum einige Chemikalien verwendet werden, ist der SchlĂŒssel zur DurchfĂŒhrung erfolgreicher Experimente und zur Erzielung genauer, zuverlĂ€ssiger und reproduzierbarer Ergebnisse.

Ethylendiamintetraacetat zur DNA-Reinigung

Drei Arten von DNA werden fĂŒr wissenschaftliche Arbeiten gereinigt: DNA aus dem Genom (genomische DNA), die gesamte DNA aus der Zelle (Gesamt-DNA) oder aus Plasmiden, die sich selbst vermehren können. Die vollstĂ€ndige Zell-DNA-Reinigung verwendet Chemikalien, die die Zerstörung der vielen Membranen einer Zelle wĂ€hrend der Zelllyse ermöglichen. Das chemische Ethylendiamintetraacetat (EDTA) wird hĂ€ufig verwendet, um Magnesiumionen zu entfernen, die fĂŒr die Aufrechterhaltung der Starrheit der ZellwĂ€nde erforderlich sind, wodurch diese bis zu dem Punkt geschwĂ€cht werden, an dem sie kollabieren oder reißen und den Zellinhalt und die DNA zur Analyse freisetzen. DarĂŒber hinaus schĂŒtzt und bewahrt EDTA die IntegritĂ€t der DNA durch die Hemmung von Enzymen, die normalerweise in der Zelle vorhanden sind, wodurch die DNA fragmentiert und unbrauchbar gemacht werden kann.

Magneisum Chlorid zur DNA-Amplifikation

Die Polymerase-Kettenreaktion (PCR) ist eine hochentwickelte Analysemethode zur Amplifikation von mehreren tausend Kopien eines DNA-MolekĂŒls, ist jedoch mit technischen Problemen und Ungenauigkeiten behaftet. Viele Wissenschaftler fĂŒhren daher routinemĂ€ĂŸig verschiedene PCR-SĂ€tze durch, um den optimalen Zustand und die optimalen Parameter fĂŒr ein bestimmtes interessierendes Gen zu finden. Eine Chemikalie, die zur DurchfĂŒhrung einer solchen Optimierung verwendet wird, ist Magnesium, das das in der PCR verwendete DNA-Polymerase-Enzym stabilisiert und als essentieller Co-Faktor fĂŒr die AktivitĂ€t des Enzyms wirkt. FĂŒr PCRs wird Magnesium in Form eines Magnesiumchloridpuffers verwendet.

Ethidiumbromid fĂŒr die DNA-FĂ€rbung

Ethidiumbromid ist ein Farbstoff, der an die DNA bindet, indem er zwischen den Nukleotiden, die eine DNA-Doppelhelix bilden, in einem als Interkalation bekannten Prozess hineinrutscht. Dieser Farbstoff kann dann mit einer UV-Lampe bestrahlt werden, so dass die DNA, an die das Ethidiumbromid gebunden wurde, sichtbar gemacht werden kann. Mindestens 1 Nanogramm DNA ist erforderlich, damit das Ethidiumbromid richtig gesehen werden kann, daher ist es ein Weg, PCR-amplifizierte DNA nachzuweisen. Obwohl es billig und weit verbreitet ist, ist es auch eine mutagene Chemikalie, von der bekannt ist, dass sie Krebs verursacht, so dass ihr Einsatz in Laboratorien stark reguliert ist und viele Wissenschaftler dazu ĂŒbergehen, weniger toxische Alternativen zu verwenden.

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